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Senior Software Engineer – AI-first & Systems (m/w/d)

Freiburg, DEPosted 29 Oct 2026Remoteworkday_se_list

Wer wir sind


CYTENA ist ein junges und schnell wachsendes Hightech-Unternehmen, das sich der Entwicklung automatisierter, hochpräziser Laborgeräte für die Life-Science-Forschung und die pharmazeutische Industrie widmet. Seine preisgekrönten Geräte werden in renommierten akademischen und pharmazeutischen Labors weltweit eingesetzt, um Arbeitsabläufe in zahlreichen Anwendungsbereichen zu automatisieren, darunter die Entwicklung stabiler Zelllinien, Einzelzell-Omics, Hochdurchsatz-Screening und Wirkstoffforschung. Seit 2019 ist CYTENA Teil der BICO-Gruppe.


Our mission is: At CYTENA, we make the development of modern therapies faster, safer, and more affordable.


Werden Sie Teil von CYTENA als Senior Software Engineer – AI-first & Systems (m/w/d) und spielen Sie eine Schlüsselrolle bei der Entwicklung und Weiterentwicklung unserer Softwarelösungen für innovative Life-Science-Technologien.


So arbeiten wir

Wir entwickeln AI-first. Unsere Engineers schreiben Code nicht mehr Zeile für Zeile. Sie formulieren Specs, orchestrieren Agenten und reviewen auf Struktur- und Systemebene. Unsere Repositories haben Guardrails und Skills, Agenten greifen über MCP auf Anforderungen und Backlog zu, und Firmware sowie erste Hardware-Tests entstehen bereits agentengesteuert. Wir arbeiten in kleinen Teams mit kurzen Iterationen, über Software, Firmware und Hardware hinweg.


Aufgaben

  • AI-first-Entwicklung als Kern deiner Arbeit: Anforderungen und Intent präzise in Specs übersetzen, Coding-Agenten orchestrieren, Ergebnisse auf Struktur- und Systemebene reviewen
  • Aufbau und Weiterentwicklung von Hardware-in-the-Loop-Testumgebungen, in denen Agenten Tests gegen reale Geräte und Simulatoren ausführen und auswerten
  • End-to-End-Verantwortung für Software und Firmware unserer Laborgeräte: von Anforderungen über Architektur und Systemintegration bis zur produktiven Lösung
  • Gestaltung der Leitplanken unserer AI-first-Entwicklung: Repository-Guardrails, Skills, Testautomatisierung, CI-Gates
  • Zusammenarbeit mit Elektronik, Optik und Applikation mit Systemblick: Schnittstellen, Protokolle und Fehlerbilder verstehen und übersetzen
  • Schnelle Prototypen und Machbarkeitsstudien für neue Produkt- und Analyse-Workflows
  • Weitergabe von AI-first-Praktiken im Team und über Teams hinweg

Qualifikationen

  • Nachweisbare Praxis in agentischer Softwareentwicklung (z. B. Claude Code, Cursor, Copilot Agent Mode). Damit meinen wir eigene Workflows, spec-driven Arbeiten und Guardrails, nicht nur Autocomplete.
  • Mehrjährige Berufserfahrung (typ. 5+ Jahre) in professioneller Software- oder Firmwareentwicklung mit Tiefe in mindestens einem Stack (z. B. C#/.NET, C/C++, Python), genug, um KI-generierten Code fundiert zu beurteilen
  • Systemdenken: Erfahrung mit Software im Zusammenspiel mit Hardware, Firmware oder Embedded-Systemen (Kommunikation, Timing, Gerätezustände, Fehlerdiagnose)
  • Erfahrung mit Testautomatisierung und CI/CD
  • Abgeschlossenes Studium in Informatik, Software Engineering, Systems Engineering, Elektrotechnik o. Ä. oder eine vergleichbare Qualifikation
  • Sehr gute Englischkenntnisse; Deutschkenntnisse von Vorteil
  • Von Vorteil: HIL-Testing oder Gerätesimulatoren, Requirements Engineering, Bildverarbeitung und KI-basierte Analyse, Webfrontends, Container-Technologien

In deiner Bewerbung interessiert uns besonders: Beschreib uns in ein paar Sätzen einen agentischen Workflow, den du produktiv nutzt, und was du dabei gelernt hast.


Was wir bieten

Ein Teil von CYTENA zu sein bedeutet gleichzeitig ein Teil von etwas Großem zu sein, denn unser Ziel ist es die Zukunft der medizinischen Entwicklung mitzugestalten. Wir sind ein aufstrebendes Life-Science Unternehmen mit mehrfach ausgezeichneten Produkten und einem coolen Team, das sich besonders durch Spaß, Freundlichkeit, Zusammenarbeit und Hilfsbereitschaft auszeichnet.

  • Agile Start-up Kultur: Wir sind ein dynamisches und international tätiges Unternehmen und sind stolz auf unsere flache Organisationsstruktur. Wir arbeiten agil und in funktionsübergreifenden Teams.
  • Flexibles Arbeiten: Bei uns geht es um Ergebnisse. Wir wollen, dass unsere Mitarbeitenden so produktiv und glücklich wie möglich sind und setzen deshalb auf ein flexibles Arbeitsmodell.
  • Teambildung: Zusammenarbeit wird bei uns großgeschrieben! Wir sind aufgeschlossen, helfen einander und veranstalten gerne Teamevents.
  • Benefits: Das CYTENA Team gibt immer sein Bestes, dafür möchten wir etwas zurückgeben. Bei uns gibt es die Wahl zwischen drei tollen Benefits: ÖPNV-Jobticket, Givve Card oder Hansefit – Deine Wahl!
  • On top: Wir bieten kostenloses Obst, Wasser und Kaffee, eine Müsli-Bar und weitere Snacks, ein gut angebundenes Office mit traumhafter Dachterrasse, Bällebad, Chillout Area, Tiefgaragen-Stellplätze und noch vieles mehr …
  • Green City Freiburg: Unser neues und modernes Green City Office findest Du im Güterbahnhof-Areal, das neue lebendige Stadtviertel von Freiburg. Vor den Toren des Hochschwarzwaldes im sonnigen Südwesten Deutschlands befindet sich die grüne Universitätsstadt mit ihrem historischen Stadtzentrum, ihrem unschlagbaren Charme und einem vielfältigen Freizeit- und Kulturangebot.
  • Betriebliche Altersvorsorge: Die Zukunft von unseren Mitarbeitenden liegt uns am Herzen. Es besteht die Möglichkeit eine Direktversicherung mit attraktiven Konditionen und einem übergesetzlichen Arbeitgeberzuschuss bei unserem Versicherungspartner abzuschließen.
  • Die Chance, etwas zu bewegen: Wir sind Teil der Life-Science Branche und unsere Arbeit ist eine großartige Möglichkeit, zur Entwicklung neuer Medikamente und Behandlungen beizutragen, die Hunderttausenden von Menschen weltweit helfen können. Wir sind zukunftsprägend!

Du möchtest ein Teil unserer Erfolgsgeschichte werden? Dann bewirb dich online über unser Bewerbungsportal. Bitte beachte, dass wir aus datenschutzrechtlichen Gründen keine Bewerbungen per E-Mail annehmen können!


At CYTENA, we don’t just accept difference — we celebrate it, we support it, and we thrive on it for the benefit of our employees, our products, and our community. We are an equal opportunity workplace and will always pride ourselves on being a collaborative environment.


BICO leverages a global portfolio of pioneering brands fusing automation, intelligence, and data to unlock scientific discovery at scale in pharma and biotech. With 53,600+ instruments installed in over 65 countries, BICO products, software, and solutions are found in more than 3,500 laboratories, including the world’s top 20 pharmaceutical companies, and have been cited in over 13,000 publications. BICO strives towards the vision to enable life-science labs to accelerate the discoveries that change lives. BICO is listed on Mid-Cap, Nasdaq Stockholm under BICO. www.bico.com 


#CYTENA

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